De darmflora wordt gedomineerd door Bacteroidetes en Firmicutes. Methanobrevibacter smithii is de meest voorkomende methanogene archeon in de menselijke darmflora en heeft een cocobacillusvorm. M. smithii is een bacterie die vaak voorkomt in de ingewanden en ontlasting van gezonde mensen en die een belangrijke rol vervult bij het mogelijk maken van een efficiënte vertering van polysachariden (complexe suikers). M. smithii doet dit door waterstof te combineren met koolstofdioxide om methaan te produceren, waarmee het de winning van energie uit voedingsstoffen ondersteunt. Methaanproducerende micro-organismen staan bekend als methanogenen. Methanobrevibacter smithii kan 10% uitmaken van alle anaerobe bacteriën (zuurstofhatende bacteriën) in de dikke darm.